蒙特梭利所谓的自由是使人从妨碍其身心和谐发展的障碍中解放出来的自由。她认为如果要建立一种合乎科学的教育，其基本原则必须使儿童获得自由。这种自由使儿童的天性得到自然表现。传统的教育提到自由时，通常带有负面意义——从权威中解放出来，从而导致混乱、不守秩序，还有各种原始欲望的无节制的满足。这种状况下，儿童所发展的自由，会造成他们行为的偏差，而不是出于他们天生的自由意志，因此他们不可能达到真正的自由。

　　蒙台梭利相信，要给儿童自由的先决条件是儿童的人格发展必须有健全的发展与构成，包括独立性、意志力、自制力等。她认为真正的自由是通过教育的协助，使潜在的力量得到发展。 “我们习惯性地为小朋友提供各种服务，其实这是很危险的，因为这样会阻碍他们自主性地开展有益的活动，我们的角色应该是帮助他们所要完成的活动。”要培养儿童意志力，成人必须鼓励他们针对一定目标采取各种行动，并且努力达到自己选定的目标，此时成人应该只是在旁监督，避免强制或者以自己的意志强加在儿童身上。而培养自制力，也就是防止儿童为满足自己活动的欲望而出现的对抗性。这依赖于成人为儿童提供各种有意义的机会。儿童的自由必须以不侵犯他人的利益为范围，因而我们对于儿童任何侵犯或干扰他人、或是由粗鲁带来伤害的行为，必须加以防范。在蒙特梭利教室自由的环境中，儿童有机会去反省自己的行为，了解行为对自己及对别人的影响，测试自己在现实环境中能力的极限，体会自我实现的感觉，了解可能令自己感到空虚与不满的情况，发觉自己的能力与缺陷。这种能发展出自我认识的机会是蒙台梭利教室的自由所带来的一种最重要的结果。